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Master Mathématiques et applications # Parcours type : Computational and mathematical biology (CMB)

RESPONSABLE

OBJECTIFS

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CMB est un parcours orienté vers l'analyse et la modélisation des systèmes biologiques complexes, et ouvert à l'international à travers la graduate school du Centre Turing des systèmes vivants (CENTURI).

Ce parcours est commun aux Masters d’informatique, de mathématiques et de biologie, et vise à réunir des étudiants d'horizons divers à fort potentiel et à profiter des synergies interdisciplinaires afin de les former à ce domaine scientifique de pointe en plein essor.

CMB propose ainsi une formation par et pour la recherche, avec de forts débouchés en thèse de doctorat, mais également dans les nombreuses entreprises du domaine ayant une politique marquée vers la R&D.

Au sein des Master de mathématiques (Mathématiques et applications ou Mathématiques appliquées et statistiques), la formation mettra l'accent sur les principaux outils de modélisation (modèles déterministes ou stochastiques, systèmes dynamiques) et sur les principaux outils de statistiques permettant l’interprétation des données biologiques (tests statistiques, estimation parametrique), en veillant à développer leurs compétences en informatiques et en biologie.

FORMATION ET RECHERCHE

La formation s’appuie sur les activités et les compétences des laboratoires de recherche membres du centre Turing des systèmes vivants (CENTURI).

PRÉ-REQUIS RECOMMANDÉS

Comme ce Master est destiné aux étudiants s’orientant vers la recherche, une licence de mathématiques ou de statistique avec Mention est requise.

SITE WEB LA FORMATION

Site WEB de la formation

PLAQUETTE DE LA FORMATION

Télécharger la plaquette de la formation au format PDF

COMPÉTENCES VISÉES

  • S'approprier les concepts de biologie nécessaires à la modélisation des systèmes vivants.
  • Utiliser et maîtriser les méthodes et outils informatiques et mathématiques pour élaborer et analyser des modèles de systèmes biologiques (équations différentielles ordinaires, stochastiques, équations aux dérivées partielles. Systèmes dynamiques discrets).
  • Utiliser et maîtriser les méthodes et outils statistiques pour analyser les données biologiques expérimentales et pour permettre la confrontation entre modèles mathématiques et systèmes biologiques.
  • Choisir et mettre en œuvre la méthodologie adaptée à la modélisation d’un problème/système biologique donné.
  • Évaluer la faisabilité et l'efficacité d'une méthodologie ou d’un traitement informatique pour l'analyse d'un système complexe.
  • Collaborer à une action/activité de recherche au sein d’une équipe interdisciplinaire.

PLAQUETTE DE LA FORMATION

Télécharger la plaquette de la formation au format PDF

Master 1 CMB mentions Mathématiques appliquées, statistique et Mathématiques et applications (60 crédits)

Semestre 1 CMB mentions Mathématiques appliquées, statistique et Mathématiques et applications (30 crédits)

Fundamentals in biology 1 (3 crédits)

CONTENU

Fondements de la biologie

Plaquette de l'enseignement.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 18 heures

UE professionnalisante 1 : Professional perspectives for biological systems modelling (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Travaux dirigés : 18 heures

Discrete modelling of dynamical biological systems 1 (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Programming and algorithms (6 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures
  • Travaux pratiques : 12 heures

Computational Biology (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 14 heures
  • Travaux pratiques : 16 heures

Probability (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 9 heures
  • Travaux dirigés : 9 heures

Continuous dynamical systems, linear algebra and modelling (6 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures
  • Travaux pratiques : 12 heures

Functional analysis (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 9 heures
  • Travaux dirigés : 9 heures

Semestre 2 CMB mentions Mathématiques appliquées, statistique et Mathématiques et applications (30 crédits)

Fundamentals of biology 2 (4 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Statistical and computational tools for biological modelling (6 crédits)

Graph theory and algorithms 1

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Statistics for biology

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Advanced statistics (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Hilbert and Fourier analysis (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Research project and scientific communication (6 crédits)

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UE professionnalisante 2 : CenTuri Seminars (2 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures

Option: mathematics or statistics (6 crédits)

EDP et analyse numérique (6 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 24 heures
  • Travaux dirigés : 36 heures

2 options statistics S2 (6 crédits)

Option: statistics (6 crédits)

Statistique décisionnelle (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 15 heures
  • Travaux dirigés : 15 heures

Signaux à temps discret, modèles déterministes et aléatoires (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 15 heures
  • Travaux dirigés : 15 heures

Chaînes de Markov, martingales (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 15 heures
  • Travaux dirigés : 15 heures

Séries chronologiques (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 10 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 8 heures

Master 2 mentions Mathématiques appliquées, statistique et Mathématiques et applications (60 crédits)

Semestre 3 CMB mentions Mathématiques appliquées, statistique et Mathématiques et applications (30 crédits)

Biological interaction networks (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 10 heures
  • Travaux dirigés : 8 heures
  • Travaux pratiques : 12 heures

Statistical inference and big data in biology (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Optimization and numerical calculus (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Interdisciplinary project in modelling (6 crédits)

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UE professionnalisante 3 : CenTuri Seminars (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 10 heures
  • Travaux dirigés : 10 heures
  • Travaux pratiques : 10 heures

Advanced biology (2 options among 3) (6 crédits)

Advanced Biology : Developmental Biology (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Advanced Biology : Immunology (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

Advanced biology : Neurobiology (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 6 heures
  • Travaux dirigés : 6 heures
  • Travaux pratiques : 6 heures

S3 Options (6 crédits)

Introduction à la logique modale (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 20 heures

Modèles de calcul naturel - MOCANA (3 crédits)

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 20 heures

Modèles à variables latentes (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Algorithmes stochastiques (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Signal et big data, compressed sensing (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Data science: Big Data (3 crédits)

Big data

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Data science: Sparse representation of signals, images, graphs (3 crédits)

Représentations parcimonieuses de signaux et images

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VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Méthodes numériques probabilistes (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 12 heures

Méthodes d'estimation paramétrique (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 12 heures
  • Travaux dirigés : 9 heures

Calcul scientifique (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 8 heures
  • Travaux dirigés : 15 heures

Calcul scientifique avancé (3 crédits)

Contenu non disponible.

VOLUME DES ENSEIGNEMENTS

  • Cours magistraux : 8 heures
  • Travaux dirigés : 15 heures

Semestre 4 CMB Computational and Mathematical Biology (30 crédits)

Master thesis (30 crédits)

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INFORMATIONS DIVERSES

Secrétariat pédagogique :

  • Sonia KERBACHE (sonia.kerbache@univ-amu.fr) tél. : 04 91 82 90 80, Aix-Marseille Université, Campus Luminy. Bâtiment TPR2 ET GRAND H. 163 av. de Luminy. case 901. 13009 Marseille.

MODALITÉS D'INSCRIPTION

RÉGIMES D'INSCRIPTION

Cette formation est accessible en

  • Formation initiale
  • Formation continue
http://formations.univ-amu.fr/2018-2019/xml/ME5SMA.xml