Master CMB , parcours : Computational and mathematical biology (CMB)

Ce Master est structuré autour de deux parcours distincts sur deux ans : Statistique et Modélisation Mathématique et Biologie Computationnelle. Ces deux parcours permettent aux étudiants d'aborder les nouveaux défis liés à l'étude des systèmes biologiques complexes.

Tout en se spécialisant dans leur discipline d'origine, les étudiants suivent des enseignements communs et participent à des projets interdisciplinaires. Quel que soit leur parcours, tous bénéficient d'enseignements en informatique, mathématiques, statistique et biologie computationnelle.

Une part importante de la formation consiste à réunir les étudiants des différents parcours du CMB autour de projets interdisciplinaires, afin de les préparer aux stages de recherche ainsi qu'à leur future insertion professionnelle.

Le Master Computational and Mathematical Biology est une formation internationale qui accorde une attention particulière à la préparation de l'avenir professionnel de ses étudiants. L'ensemble des enseignements est ainsi dispensé en anglais, langue largement utilisée dans le monde de la recherche.

Ce Master étant une formation sélective fortement orientée vers la recherche, les candidats doivent être titulaires d'une licence en mathématiques ou en statistique obtenue avec de très bons résultats.

Une bonne maîtrise de l'anglais est indispensable : l'ensemble des enseignements est dispensé en anglais et le Master accueille des étudiants internationaux.

Le Master CENTURI Computational and Mathematical Biology (CMB) délivre un diplôme d'Aix-Marseille Université et prépare les étudiants à la recherche scientifique.

Selon le parcours suivi :

• les étudiants du parcours Biologie Computationnelle (BIP-CMB) obtiennent un diplôme de Master Biologie-Santé, parcours Biologie Intégrative et Physiologie ;
• les étudiants des parcours Statistique et Modélisation Mathématique (MAS-CMB) obtiennent un diplôme de Master Mathématiques Appliquées, Statistique.

Tous les étudiants de la formation CMB suivront des enseignements leur permettant d'acquérir les bases en biologie nécessaires à la compréhension des problématiques actuelles dans ce domaine, ainsi que les outils mathématiques nécessaires à la modélisation (systèmes dynamiques discrets et continus) et les outils statistiques permettant d'interpréter les données biologiques. Des enseignements en informatique scientifique leur permettront également d'acquérir les compétences nécessaires à la simulation numérique des modèles.

Les étudiants issus d'une formation en mathématiques suivront des enseignements en mathématiques appliquées (optimisation, algèbre linéaire) et en statistique pour la science des données.

Ils pourront ensuite choisir d'approfondir leurs connaissances soit en statistique et analyse de données massives, soit en analyse théorique et numérique des équations aux dérivées partielles (EDP) déterministes ou des problèmes stochastiques.

Le parcours orienté statistique et données massives permettra d'acquérir les méthodes nécessaires à l'exploration, l'analyse, l'interprétation et la prédiction à partir de données biologiques. Certains enseignements seront mutualisés avec le Master « Mathématiques appliquées et statistique », notamment avec le parcours Data Science.

Le parcours orienté modélisation mathématique permettra d'étudier, d'analyser et de prédire le comportement de systèmes biologiques à l'aide de modèles mathématiques. Certains enseignements seront mutualisés avec le Master « Mathématiques et Applications », notamment avec le parcours ANADEAL en deuxième année.

Pour tous les étudiants du CMB. Participer à une activité de recherche au sein d'une équipe interdisciplinaire.

Utiliser et maîtriser les méthodes et outils statistiques permettant d'analyser des données biologiques expérimentales ou de confronter des modèles mathématiques aux systèmes biologiques.

Pour les étudiants issus d'une formation en mathématiques. Acquérir les concepts biologiques nécessaires à la modélisation des systèmes vivants. Utiliser et maîtriser les méthodes et outils numériques et mathématiques permettant de construire et d'analyser des modèles de systèmes biologiques (équations différentielles ordinaires, équations différentielles stochastiques, équations aux dérivées partielles, systèmes dynamiques discrets).

Choisir et mettre en œuvre une méthodologie adaptée à la modélisation d'un problème ou d'un système biologique donné. Évaluer la faisabilité et l'efficacité d'une approche numérique pour l'analyse d'un système complexe.

Les projets en groupe et les stages en laboratoire de recherche permettront aux étudiants de mettre en pratique des approches interdisciplinaires et d'interagir directement avec les chercheurs des instituts du Turing Center for Living Systems (CENTURI).

Les étudiants du Master CMB doivent effectuer deux stages au cours de leur formation :

• un stage d'une durée minimale de six semaines en première année de Master (M1) ;
• un stage d'une durée de 4 à 6 mois en deuxième année de Master (M2).

En M2, les étudiants ont également la possibilité d'effectuer leur stage à l'étranger.

Le Master CMB prépare les diplômés à des carrières dans la recherche académique ou la R&D, en France comme à l'international. Ils peuvent notamment poursuivre en doctorat ou occuper des postes d'ingénieur de recherche dans les domaines de l'analyse de données biologiques, de la modélisation des systèmes biologiques et de l'analyse des réseaux d'interactions.

Les diplômés peuvent également intégrer les départements de recherche et développement d'entreprises privées, notamment dans les secteurs de la santé, de la pharmacologie et des biosystèmes, ainsi que dans des métiers liés à la science des données et à l'analyse de données massives (Big Data).

Avec ce diplôme de Master, les diplômés pourront intégrer des instituts de recherche internationaux, notamment en poursuivant un doctorat ou en occupant un poste d'ingénieur de recherche dans des domaines tels que l'analyse de données, la modélisation des systèmes biologiques ou l'analyse des réseaux d'interactions.

Le Master CMB est l'une des activités du Turing Centre for Living Systems (CENTURI), un projet interdisciplinaire basé à Marseille (France).

Turing Centre for Living Systems (CENTURI)

Un enseignement spécifique permet aux étudiants de découvrir les différents débouchés professionnels à l'interface entre mathématiques et biologie. Les échanges avec des chercheurs et des professionnels leur donnent une meilleure connaissance des carrières possibles, aussi bien dans le monde académique que dans le secteur privé. Associé aux projets interdisciplinaires et aux stages de recherche, cet enseignement contribue à développer les compétences et la connaissance du monde professionnel nécessaires à la préparation de leur future carrière.

Les étudiants peuvent effectuer leurs stages de première et deuxième année (M2) à l'étranger.

Les étudiants sont sélectionnés sur la base de leur dossier de candidature (MonMaster, Études en France ou eCandidat) et, le cas échéant, à l'issue d'un entretien oral.

La lettre de motivation et, lorsqu'il a lieu, l'entretien oral doivent témoigner d'un fort intérêt pour l'interdisciplinarité à l'interface entre mathématiques, statistique et biologie.

• SCIENCES, Marseille Luminy
  Cours de biologie, cours spécifiques CMB
• SCIENCES, Marseille St-Charles
  Seulement pour quelques cours communs avec d'autres étudiants de mathématiques