L1en2ans Pasteur

Semestre 1

• Biologie (6 ECTS)
• Outils mathématiques (4 ECTS)
• Grands enjeux (2 ECTS)
• Méthodologie (3 ECTS)
• Anglais
• Enseignements de renforcement :
  • Calculus via PrescriSciences en mathématiques
  • Préparation à Chimie
  • Expression écrite et orale de la langue française

Semestre 2

• Physique (3 ECTS)
• Thermochimie (3 ECTS)
• Anglais (3 ECTS)
• Projet personnel et professionnel de l'étudiant (3 ECTS)
• Calculus via PrescriSciences en mathématiques

Semestre 3

• Terre vivante (6 ECTS)
• Chimie (5 ECTS)
• Méthodes et outils pour le champ disciplinaires

Semestre 4

• Blocs d'options, déterminés par le choix de mention :
  • Mention Chimie
    • Architecture moléculaire (4 ECTS)
    • Introduction à la chimie expérimentale (7 ECTS)
    • Outils mathémathiques pour la chimie (4 ECTS)
    • De l'atome vers la molécule : approche orbitalaire (3 ECTS)
  • Mention Sciences sanitaires et sociales
    • Sociologie de la santé (4 ECTS)
    • Vieillissement : aspects cognitifs, économiques, juridiques (6 ECTS)
    • Biologie cellulaire (4 ECTS)
    • Physiologie (4 ECTS)
  • Mention Sciences de la vie
    • Biologie cellulaire (4 ECTS)
    • Physiologie (4 ECTS)
    • Biochimie et biologie moléculaire (8 ECTS)
    • Pratiques expérimentales en biologie (2 ECTS)
  • Mention Sciences de la vie et de la Terre
    • Biologie cellulaire (4 ECTS)
    • Morpho-anatomie du vivant (6 ECTS)
    • Pratique de la géologie (4 ECTS)
    • Découverte de la pratique scientifique (4 ECTS)

Une vision globale et suffisante de la biologie pour des L1 scientifiques, qu'ils soient futurs chimistes, SVT, SSS ou SV.

C'est un enseignement en parallèle de CHIMIE et TERRE VIVANTE qui permet de délimiter les spécicités et complémentarités entre les mentions SV, SVT et CHIMIE.

Les 4 disciplines que sont la BIOCHIMIE, la BIOLOGIE MOLECULAIRE, la BIOLOGIE CELLULAIRE et la PHYSIOLOGIE coexistent dans ce cours intégré alors qu'elles deviendront spécialités pour le jeu d'options SV au semestre 2.

La logique du Vivant
De l’organisme vivant à la molécule
Les édifices macromoléculaires et les Biomolécules
La cellule
Les organes
Les organismes
Caractéristiques de la matière vivante
Universalité, simplicité et complexité du vivant
Propriétés communes aux êtres vivants
Les biomolécules
Composition chimique des biomolécules
Groupes chimiques fonctionnels
Principaux types de liaisons entre biomolécules
Les différentes classes de biomolécules
L'eau dans l'organisme
Propriétés de l'eau
Structure de l'eau
La liaison hydrogène
L'eau en tant que solvant
Ionisation de l'eau - équilibre acido-basique
Notion de pH
Notion d'acide et de base
Notion de force des acides et des bases
Les systèmes tampons
Courbe de titration
Pouvoir tampon des couples acide faible - base conjuguée
Systèmes tampons en biologie
L'eau en tant que réactant
Glucides
Monosaccharides
Structure générale
Cyclisation des oses
Oses d'interet biologique
Oligosaccharides et polysaccharides
La liaison osidique
Disaccharides
Polysaccharides
Glycoconjugués
Glycolipides
Glycoprotétines
Protéines
Acides aminés
Classification
Propriétés Physicochimiques
Les protéines
Classification et diversité des fonctions biologiques
La liaison peptidique
Propriétés physisico-chimiques des protéines
Structure des protéines
Dénaturation
Les Enzymes
Propriétés des enzymes
Mode d'action des enzymes
Cinétique enzymatique
Activité enzymatique-activité spécifique
Régulation de l'activité enzymatique
Les acides Nucléiques
Les constituants
Les bases
Les nucléosides
Les nucléotides
L'ADN
Localisation
Fonction
Structure I-aire
Structure II-aire
Tailles et formes
L'ARN
Localisation
Organisation structurale
Les différents types
Les lipides
Les acides gras
Les acides gras saturés
Les acides gras insaturés
Propriétés
Lipides simples
Glycérides (acylglycérols)
Cérides
Stérides
Lipides Complexes
Glycérolipides
Sphingolipides
Phospholipides - formation des membranes biologiques

Délimiter le vivant: Parois Cellulaires et Membranes pour protéger, échanger
Membrane plasmique
Organisation spontanée vs Eau
Composition
Modalités des échanges
Parois
Bactérienne
Végétale

Fournir de l'énergie au vivant
Introduction à la Bioénérgetique
Généralités
Variation de l'énergie libre
Réactions RedOx
Molécules importantes du catabolisme
Respiration
Etapes d'extraction de l'énérgie chez les chimiotrophes aérobies euca
utilisation des sucres
utilisation des acides gras
La mitochondrie et la conversion énergetique
Exemples de respiration bacterienne
Phototrophie et autotrophie
Phase claire de la photosyntèse= cas de phototrophie chez les euca
Phase sombre de la photosyntèse= cas d'autotrophie chez les euca
Exemples de phototrophie et autotrophie bactérienne

Avoir un plan et l'executer
différences proca-euca
Stuctures et fonctions de l'ADN; structure des chromosomes
Noyau ou pas ?
réplication
Transcription
Traduction

Diviser la cellule
division chez les proca
la mitose des euca
Meiose

Le système endomembranaire: des organites qui travaillent de concert
RE
Structure-fonction
appareil de Golgi
structure-fonction
Lysosomes
structure-fonction
Vacuoles
structure-fonction
Les échanges entres organites
au travers des Mbnes
vésiculaire
exemple de la sécretion de l'insuline
exemple de l'endocytose du LDL

Metazoaire, différenciation
Formation des organes et tissus
lame basale, protéines d'adhésion, protéines de jonction cellulaire
Communication entre cellules
différents modes de communication: par contact ou par messager sécrété, les récepteurs membranaires, les voies de transduction du signal (notions seulement)
Physiologie végétale

Notions de Physio
Milieu intérieur et homéostasie 
tissus et organes
système endocrinien (pancréas/insuline) 
Méthodes d’étude en Physiologie

1. Calcul dans R
   • Calcul fractionnaire (addition, multiplication et division des fractions) ;
   • équation et inéquation de degré 1 (ax + b = 0 et ax + b > 0...) ;
   • équation et inéquation de degré 2 (ax2 + bx + c = 0 et ax2 + bx + c > 0...) ;
   • règles de calcul pour les valeurs absolues ;
   • règles de calcul pour les racines carrées ;
   • règles de calcul pour les ln ;
   • définition et application du logarithme décimal au calcul 
   • règles de calcul pour les exponentielles ; 
   • règles de calcul pour les puissances et application aux simplifications des puissances de 10 ;
   • trigonométrie (définition du cos, du sinus et de la tangente avec le cercle trigonométrique et formules élémentaires).
2. Fonctions réelles d’une variable réelle
   • Étude des fonctions usuelles : valeur absolue, cos, sin, tan, ln et exp ;
   • Calcul des dérivées et tracé des tangentes ;
   • Étude complète d’une fonction simple (type x 7→ x exp(−x 2 ), x 7→ x cos(x) , x 7→ x sin(x) ...) : ensemble de définition, limites, tableau des variations, branches infinies et tracé de la courbe.
3. Intégration
   • Définition de l’intégrale comme aire sous la courbe ;
   • Techniques de calcul de primitives : primitives usuelles immédiates (x n a pour primitive x n+1 n+1 ...) , composition de fonctions ( primitive de U’/U ,U’exp(U)...) 
4. Équations différentielles
   • Équations différentielles linéaires du premier ordre à coefficients constants constants et avec second membre constant (dy/dx + ay = b). 

Objectifs:
1) Se sensibiliser aux grands enjeux actuels des sciences et à leurs applications dans les domaines de la santé, de la chimie et de l’environnement
2) Comprendre « à quoi peuvent servir » la biologie, les sciences de l’environnement, la chimie et vous aider dans votre choix d’orientation
3) Identifier les problématiques comtemporaines et les questionnements éthiques soulevés par l’utilisation des sciences
4) Prendre conscience de la responsabilité des scientifiques par rapport à la diffusion des informations scientifiques au sein de la société

Thèmes abordés:
(SV) Cellules souches, Perturbateurs endocriniens
(SVT) Erosion de la biodiversité, Complexité des changements globaux
(Chimie) Chimie du quotidien, Chimie durable
 

Comprendre le fonctionnement cérébral et les effets du contexte au cours des apprentissages, des révisions, pendant un examen, pour pouvoir :

• réfléchir sur ses connaissances, sur l’efficacité de ses méthodes d’apprentissage et de révision, sur ses motivations ;
• comprendre les raisonnements engagés pour résoudre des problèmes complexes, déconstruire (lorsque nécessaire) certaines idées erronées concernant ses capacités, les efforts et le travail, gérer le stress de certaines situations d’évaluation, développer des méthodes de travail (connaissances et savoir-faire) efficaces compte tenu du fonctionnement de la mémoire, et des postures (savoir-être) adaptées pour améliorer ses apprentissages et le développement des compétences visées par la formation choisie.

TD 1– prise de notes :

• apprendre à structurer ses notes et ses cours
• applications : méthode Cornell, mise en images

TD 2– méthodes de travail :

• échange sur vos méthodes de travail
• liens entre les UE du L1 ; planning
• travail attendu pour le carnet de bord

TD 3– résolution de problèmes

• apprendre à résoudre des exercices
• méthode lampes et autres méthodes

TD 4– note de synthèse (1) :

• apprendre à décomposer des documents et rédiger une note de synthèse

TD 5– note de synthèse (2)

• application : relevé d’idées, travail en groupe

TD 6– apprentissage en profondeur (1)

• apprendre à faire une recherche de sources externes
• application au cours de Méthodologie

TD 7– note de synthèse (3)

• évaluation des notes de synthèse en groupe

TD 8– apprentissage en profondeur (2)

• présentation orale des étudiants

TD 9– auto-évaluation

• apprendre à élaborer un questionnaire
• rendre 5 (ou plus) questions avec corrections
• travail individuel à rendre : TD noté

TD 10– esprit critique « interrogation élaboratrice »

• développer son sens critique
• application : travail en groupe sur les arguments fallacieux

TD 11 – méthode jigsaw

• apprendre à travailler en groupe

Cette UE vise à développer les compétences des étudiant·es en anglais dans un contexte scientifique. Ce cours permet aux étudiant·es d'acquérir le vocabulaire technique, de lire et de rédiger des documents scientifiques, et de s'exercer à la présentation orale en anglais. Cette formation prépare les étudiants à évoluer dans un environnement académique international.

L'objectif de l'UE Calculus est, d'une part, de s'assurer une bonne maîtrise des prérequis mathématiques vus au lycée et, d'autres part, de développer des automatismes calculatoires qui sont indispensables pour bien réussir sa première année de licence scientifique.

Deux outils numériques d'aide à la réussite seront mis à disposition des étudiants :
- La page ametice PrescriScieneces-Maths fournit des ressources pour apprendre, s'exercer et s'évaluer sur l'intégralité du programme de la spécialité maths du lycée.
- La plateforme MaPS (Maths Pour les Sciences) permet de certifier l'acquisition d'un certain niveau de compétences sur un ensemble de savoir-faire mathématiques.

Les étudiants ont un accès libre à ces deux environnements numériques de travail sur lesquels ils doivent travailler en autonomie.
Un programme de travail hebdomadaire est fourni aux étudiants avec une séparation des tâches distancielle asynchrone (travail à la maison) et présentielles synchrones.
Un tuteur encadre les étudiants 2 heures par semaine, en fournissant soutien scolaire et aide méthodologique sous un regard bienveillant.

Cette UE initie les étudiants aux bases essentielles de la chimie, nécessaires pour le cours de Chimie de l'année suivante.

L'objectif de l'UE est de renforcer les compétences des étudiants en communication. Elle se concentre sur l'amélioration de l'expression écrite, en particulier en lien avec la rédaction scientifique, ainsi que sur la maîtrise de l'expression orale dans un contexte académique. Les étudiants apprendront à structurer leurs idées et à adapter leur langage à différents publics.

Optique géométrique : la lumière, l'indice optique et le rayon lumineux. Miroir plan, Lois de Snell-Descartes. Formations des images à travers un système optique, les lentilles minces et la relation de conjugaison.

Électricité : Le circuit électrique et ses dipôles, tension et intensité, lois de Kirchhoff. Résistance et résistivité, loi d'Ohm, association de résistances. Condensateur et capacité, circuit RC, charge et décharge.

TP optique : lentilles minces, oeil au repos et microscope

TP électricité : pont diviseur de tensions, oscilloscope, circuit RC

Les éléments fondamentaux et théoriques seront appréhendés en Amphi sous forme de cours magistraux. Ces connaissances seront ensuites mobilisées lors de deux séances de TD (2h chacune) et de deux séances de TP (2h chacune).

Programme :

Biomes / Trois domaines du vivant / Phylogénie / Archées-bactéries-virus / Evolution / Opistho / Plantes / Plantes-pollinisateurs / Parasites

Objectifs :

• Découvrir les domaines et activités professionnels accessibles à l’issue des études engagées
• Identifier les parcours de formation post licences existants et accessibles à l’issue des 3 années d’études
• Acquérir les connaissances utiles en communication, en projet et en gestion des entretiens professionnels
• Engager une réflexion personnelle sur le sens de sa démarche de formation en mettant en perspective ses projets de formation, professionnels et personnel
• Découvrir les services du SUIO

Contenus :

• Présentation orale des participants
• Constitution des groupes de travail afin de réaliser une cartographie des métiers liée aux domaines d'études
• Élaborer un guide d’entretien à soumettre aux professionnels du secteur
• Rencontrer les professionnels du secteur
• Apports sur la communication écrite et orale
• Apports sur les enjeux du projet de formation, professionnel et personnel et de vie
• Présentation orale des projets de groupes
• Accompagnement des étudiants dans l’élaboration de leurs projets de formation, professionnel et personnel
• Production du projet personnel et professionnel étudiant
• Production écrite et présentation orale
• Visites organisées en collaboration avec le SUIO

SEMAINE 0 (semaine de la rentrée)
Introduction à deux voix 

La matière de l'Univers / BIGBANG
Système solaire / PLANETES ET TERRE

Les enveloppes terrestres "solides"
La vie et l'habitabilité... (geologie)
La vie et l'habitabilité... (écologie)

Les enveloppes terrestres "fluides"
Biomes terrestres et marins

Domaines du vivant, classifications
+ archées, bactéries
TD J'habite un systeme solaire

Evolution et phylogénie
Histoire de la Terre (à développer avec climat)

OPISTHO1
PLANTES1
TD Interactions biotiques

La tectonique des plaques +cycles roches wilson  (domaines structuraux)
Les impacts anthropiques 1

OPISTHO2
PLANTES2
TD Terre solide (zone d'ombre, Eratostene, cinématique plaques)

Les impacts anthropiques 2
OPISTHO3
PLANTES3

TP Parasites

Les enjeux de l'Anthropocène
TD Ressources (sac à dos écologique...)

1) Description (plan du cours détaillé)

Partie « de l’atome vers la molécule »

1) Rappels sur la structure de l’atome

2) Tableau périodique : présentation, recherche de propriétés physico-chimique (électronégativité, dimension de l’atome)

3) Configuration électronique (version simplifiée)

4) Modèle de Lewis (charges formelles et degré d’oxydation)

5) Représentation de molécules planes, nomenclature des fonctions chimiques

6) Stéréochimie : géométrie autour du carbone (VSEPR, représentation 3D, configuration)

Partie « chimie des solutions »

1) Introduction à la réaction en solution aqueuse

2) Equilibres acido-basiques

3) Equilibres d’oxydoréduction

Cet enseignement a pour objectif l'acquisistion de connaissances et de compétences relatives aux méthodes et outils couremment utilisées dans les professions liées aux 3 champs disciplinaires que sont la Chimie, la SVT et la SV.

PhylogenieTD2h

CartographieTD2h

Inverser le tempsTD2h

ChimieTD2h

ChimieTD2h

MicroscopiesTD2h

Les techniques de l'ADN-1TD2h

Les techniques de l'ADN-2TD2h

TP Plantes-PollinisateursTP3h

TP initiationSV TP4h

TP Chimie des SolutionsTP3h

TP Chimie RedOxTP3h

Ces cours sont en commun avec le Portail Pasteur. Les descriptifs des UE sont disponibles sur le site "Formations" de l'université :

https://formations.univ-amu.fr/fr/portail/3SLP/PRSLP3C1

Page "ENSEIGNEMENTS", Semestre 2, Blocs "Les notions fondamentales..." et "Outils et pratiques...".